Protein–RNA interactions for Protein: O89079

Cope, Coatomer subunit epsilon, mousemouse

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopeO89079 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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CopeO89079 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CopeO89079 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CopeO89079 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CopeO89079 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CopeO89079 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CopeO89079 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CopeO89079 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CopeO89079 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CopeO89079 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CopeO89079 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CopeO89079 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CopeO89079 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CopeO89079 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CopeO89079 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CopeO89079 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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CopeO89079 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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CopeO89079 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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CopeO89079 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CopeO89079 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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CopeO89079 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CopeO89079 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CopeO89079 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CopeO89079 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CopeO89079 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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CopeO89079 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CopeO89079 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CopeO89079 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CopeO89079 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CopeO89079 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CopeO89079 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CopeO89079 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CopeO89079 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CopeO89079 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CopeO89079 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CopeO89079 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CopeO89079 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CopeO89079 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CopeO89079 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CopeO89079 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CopeO89079 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CopeO89079 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CopeO89079 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CopeO89079 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CopeO89079 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CopeO89079 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CopeO89079 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CopeO89079 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CopeO89079 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CopeO89079 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.4 ms