Protein–RNA interactions for Protein: O88958

Gnpda1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnpda1O88958 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms