Protein–RNA interactions for Protein: O88879

Apaf1, Apoptotic protease-activating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apaf1O88879 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apaf1O88879 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apaf1O88879 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apaf1O88879 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apaf1O88879 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apaf1O88879 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apaf1O88879 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Apaf1O88879 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apaf1O88879 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apaf1O88879 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apaf1O88879 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apaf1O88879 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apaf1O88879 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apaf1O88879 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apaf1O88879 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apaf1O88879 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apaf1O88879 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apaf1O88879 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apaf1O88879 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apaf1O88879 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apaf1O88879 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apaf1O88879 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apaf1O88879 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apaf1O88879 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apaf1O88879 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apaf1O88879 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apaf1O88879 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apaf1O88879 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apaf1O88879 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apaf1O88879 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apaf1O88879 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apaf1O88879 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apaf1O88879 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apaf1O88879 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apaf1O88879 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apaf1O88879 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apaf1O88879 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apaf1O88879 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apaf1O88879 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apaf1O88879 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apaf1O88879 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apaf1O88879 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apaf1O88879 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apaf1O88879 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apaf1O88879 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apaf1O88879 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apaf1O88879 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apaf1O88879 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apaf1O88879 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apaf1O88879 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apaf1O88879 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apaf1O88879 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Apaf1O88879 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apaf1O88879 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apaf1O88879 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apaf1O88879 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apaf1O88879 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apaf1O88879 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apaf1O88879 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apaf1O88879 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Apaf1O88879 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Apaf1O88879 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Apaf1O88879 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Apaf1O88879 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Apaf1O88879 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Apaf1O88879 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Apaf1O88879 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Apaf1O88879 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Apaf1O88879 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Apaf1O88879 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Apaf1O88879 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Apaf1O88879 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Apaf1O88879 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Apaf1O88879 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Apaf1O88879 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Apaf1O88879 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Apaf1O88879 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Apaf1O88879 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Apaf1O88879 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Apaf1O88879 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Apaf1O88879 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apaf1O88879 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apaf1O88879 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apaf1O88879 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apaf1O88879 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apaf1O88879 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apaf1O88879 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apaf1O88879 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apaf1O88879 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apaf1O88879 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apaf1O88879 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apaf1O88879 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Apaf1O88879 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apaf1O88879 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apaf1O88879 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apaf1O88879 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apaf1O88879 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apaf1O88879 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apaf1O88879 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apaf1O88879 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms