Protein–RNA interactions for Protein: O88704

Hcn1, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn1O88704 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hcn1O88704 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hcn1O88704 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hcn1O88704 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hcn1O88704 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Hcn1O88704 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hcn1O88704 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hcn1O88704 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hcn1O88704 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hcn1O88704 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hcn1O88704 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hcn1O88704 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hcn1O88704 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hcn1O88704 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hcn1O88704 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hcn1O88704 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hcn1O88704 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hcn1O88704 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hcn1O88704 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hcn1O88704 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hcn1O88704 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hcn1O88704 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hcn1O88704 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hcn1O88704 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hcn1O88704 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hcn1O88704 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hcn1O88704 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hcn1O88704 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hcn1O88704 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hcn1O88704 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hcn1O88704 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hcn1O88704 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hcn1O88704 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hcn1O88704 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hcn1O88704 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hcn1O88704 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hcn1O88704 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hcn1O88704 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hcn1O88704 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Hcn1O88704 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hcn1O88704 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hcn1O88704 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Hcn1O88704 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Hcn1O88704 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hcn1O88704 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hcn1O88704 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hcn1O88704 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hcn1O88704 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hcn1O88704 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hcn1O88704 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hcn1O88704 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hcn1O88704 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hcn1O88704 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hcn1O88704 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hcn1O88704 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hcn1O88704 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hcn1O88704 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hcn1O88704 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hcn1O88704 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hcn1O88704 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hcn1O88704 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hcn1O88704 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hcn1O88704 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hcn1O88704 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hcn1O88704 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hcn1O88704 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hcn1O88704 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hcn1O88704 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hcn1O88704 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hcn1O88704 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hcn1O88704 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hcn1O88704 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hcn1O88704 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hcn1O88704 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Hcn1O88704 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hcn1O88704 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hcn1O88704 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hcn1O88704 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hcn1O88704 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hcn1O88704 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hcn1O88704 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hcn1O88704 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hcn1O88704 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hcn1O88704 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hcn1O88704 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hcn1O88704 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hcn1O88704 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hcn1O88704 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hcn1O88704 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hcn1O88704 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hcn1O88704 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hcn1O88704 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hcn1O88704 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hcn1O88704 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hcn1O88704 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hcn1O88704 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hcn1O88704 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hcn1O88704 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Hcn1O88704 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hcn1O88704 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms