Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BlmO88700 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BlmO88700 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BlmO88700 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BlmO88700 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BlmO88700 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BlmO88700 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BlmO88700 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BlmO88700 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BlmO88700 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BlmO88700 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BlmO88700 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BlmO88700 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BlmO88700 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BlmO88700 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BlmO88700 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BlmO88700 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BlmO88700 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BlmO88700 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BlmO88700 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BlmO88700 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BlmO88700 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BlmO88700 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BlmO88700 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BlmO88700 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BlmO88700 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BlmO88700 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BlmO88700 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BlmO88700 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BlmO88700 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BlmO88700 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BlmO88700 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BlmO88700 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BlmO88700 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BlmO88700 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BlmO88700 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BlmO88700 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BlmO88700 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BlmO88700 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BlmO88700 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BlmO88700 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BlmO88700 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BlmO88700 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BlmO88700 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BlmO88700 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BlmO88700 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BlmO88700 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BlmO88700 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BlmO88700 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BlmO88700 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BlmO88700 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BlmO88700 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BlmO88700 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BlmO88700 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BlmO88700 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BlmO88700 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BlmO88700 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BlmO88700 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
BlmO88700 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BlmO88700 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BlmO88700 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BlmO88700 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BlmO88700 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BlmO88700 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BlmO88700 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BlmO88700 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BlmO88700 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BlmO88700 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BlmO88700 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BlmO88700 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BlmO88700 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BlmO88700 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BlmO88700 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BlmO88700 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BlmO88700 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BlmO88700 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BlmO88700 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
BlmO88700 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BlmO88700 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BlmO88700 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
BlmO88700 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BlmO88700 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
BlmO88700 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BlmO88700 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BlmO88700 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BlmO88700 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BlmO88700 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BlmO88700 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BlmO88700 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BlmO88700 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BlmO88700 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BlmO88700 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BlmO88700 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BlmO88700 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BlmO88700 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BlmO88700 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BlmO88700 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BlmO88700 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BlmO88700 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BlmO88700 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms