Protein–RNA interactions for Protein: O88520

Shoc2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shoc2O88520 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shoc2O88520 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms