Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
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Dnmt3bO88509 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Dnmt3bO88509 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dnmt3bO88509 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Dnmt3bO88509 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dnmt3bO88509 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Dnmt3bO88509 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Dnmt3bO88509 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Dnmt3bO88509 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dnmt3bO88509 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dnmt3bO88509 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Dnmt3bO88509 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Dnmt3bO88509 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Dnmt3bO88509 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnmt3bO88509 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Dnmt3bO88509 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Dnmt3bO88509 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Dnmt3bO88509 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3bO88509 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3bO88509 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3bO88509 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3bO88509 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3bO88509 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3bO88509 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3bO88509 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3bO88509 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3bO88509 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3bO88509 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3bO88509 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3bO88509 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3bO88509 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3bO88509 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3bO88509 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3bO88509 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3bO88509 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3bO88509 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3bO88509 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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