Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CntfrO88507 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
CntfrO88507 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CntfrO88507 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CntfrO88507 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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CntfrO88507 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
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CntfrO88507 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CntfrO88507 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CntfrO88507 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CntfrO88507 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CntfrO88507 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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