Protein–RNA interactions for Protein: O88398

Avil, Advillin, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AvilO88398 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AvilO88398 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AvilO88398 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AvilO88398 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AvilO88398 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AvilO88398 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AvilO88398 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AvilO88398 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AvilO88398 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AvilO88398 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AvilO88398 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AvilO88398 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AvilO88398 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
AvilO88398 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AvilO88398 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AvilO88398 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AvilO88398 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AvilO88398 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AvilO88398 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AvilO88398 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AvilO88398 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AvilO88398 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AvilO88398 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AvilO88398 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AvilO88398 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AvilO88398 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AvilO88398 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AvilO88398 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AvilO88398 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AvilO88398 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AvilO88398 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AvilO88398 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AvilO88398 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AvilO88398 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AvilO88398 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AvilO88398 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AvilO88398 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AvilO88398 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AvilO88398 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AvilO88398 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AvilO88398 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AvilO88398 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AvilO88398 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
AvilO88398 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AvilO88398 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AvilO88398 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AvilO88398 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
AvilO88398 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AvilO88398 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AvilO88398 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AvilO88398 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AvilO88398 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AvilO88398 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AvilO88398 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AvilO88398 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AvilO88398 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AvilO88398 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AvilO88398 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AvilO88398 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AvilO88398 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AvilO88398 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
AvilO88398 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AvilO88398 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AvilO88398 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AvilO88398 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AvilO88398 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AvilO88398 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AvilO88398 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AvilO88398 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AvilO88398 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AvilO88398 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AvilO88398 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AvilO88398 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AvilO88398 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AvilO88398 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
AvilO88398 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AvilO88398 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AvilO88398 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AvilO88398 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AvilO88398 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AvilO88398 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AvilO88398 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AvilO88398 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AvilO88398 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AvilO88398 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AvilO88398 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AvilO88398 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AvilO88398 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AvilO88398 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AvilO88398 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AvilO88398 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AvilO88398 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AvilO88398 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AvilO88398 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AvilO88398 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AvilO88398 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AvilO88398 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AvilO88398 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AvilO88398 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AvilO88398 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms