Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

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Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tnnt1O88346 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Tnnt1O88346 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tnnt1O88346 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tnnt1O88346 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tnnt1O88346 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tnnt1O88346 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tnnt1O88346 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
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Tnnt1O88346 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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Tnnt1O88346 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
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Tnnt1O88346 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tnnt1O88346 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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