Protein–RNA interactions for Protein: O70309

Itgb5, Integrin beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb5O70309 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms