Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms