Protein–RNA interactions for Protein: O70174

Chrna4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna4O70174 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Chrna4O70174 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Chrna4O70174 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Chrna4O70174 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Chrna4O70174 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Chrna4O70174 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Chrna4O70174 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Chrna4O70174 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Chrna4O70174 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Chrna4O70174 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Chrna4O70174 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Chrna4O70174 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Chrna4O70174 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.2 ms