Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms