Protein–RNA interactions for Protein: O54967

Tnk2, Activated CDC42 kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnk2O54967 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnk2O54967 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms