Protein–RNA interactions for Protein: O54942

Cldn5, Claudin-5, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn5O54942 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Cldn5O54942 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
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Cldn5O54942 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms