Protein–RNA interactions for Protein: O54909

Rdh16, Cis-retinol androgen dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16O54909 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh16O54909 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh16O54909 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh16O54909 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh16O54909 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh16O54909 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh16O54909 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh16O54909 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh16O54909 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh16O54909 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh16O54909 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh16O54909 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh16O54909 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh16O54909 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh16O54909 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh16O54909 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh16O54909 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh16O54909 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh16O54909 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh16O54909 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh16O54909 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh16O54909 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh16O54909 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh16O54909 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh16O54909 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh16O54909 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh16O54909 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh16O54909 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh16O54909 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh16O54909 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh16O54909 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh16O54909 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh16O54909 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh16O54909 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh16O54909 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh16O54909 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh16O54909 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh16O54909 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh16O54909 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh16O54909 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh16O54909 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh16O54909 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh16O54909 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh16O54909 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh16O54909 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh16O54909 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh16O54909 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh16O54909 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh16O54909 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh16O54909 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh16O54909 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh16O54909 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh16O54909 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh16O54909 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh16O54909 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh16O54909 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh16O54909 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh16O54909 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh16O54909 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh16O54909 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh16O54909 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh16O54909 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh16O54909 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh16O54909 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh16O54909 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh16O54909 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh16O54909 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh16O54909 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh16O54909 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh16O54909 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh16O54909 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh16O54909 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh16O54909 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh16O54909 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh16O54909 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh16O54909 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh16O54909 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh16O54909 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh16O54909 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh16O54909 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh16O54909 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh16O54909 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh16O54909 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh16O54909 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh16O54909 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh16O54909 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh16O54909 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh16O54909 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh16O54909 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh16O54909 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh16O54909 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh16O54909 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh16O54909 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh16O54909 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh16O54909 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh16O54909 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh16O54909 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh16O54909 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh16O54909 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh16O54909 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms