Protein–RNA interactions for Protein: O54851

Gjd2, Gap junction delta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjd2O54851 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjd2O54851 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjd2O54851 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjd2O54851 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjd2O54851 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjd2O54851 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjd2O54851 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjd2O54851 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjd2O54851 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjd2O54851 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gjd2O54851 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gjd2O54851 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gjd2O54851 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gjd2O54851 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gjd2O54851 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gjd2O54851 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjd2O54851 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjd2O54851 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjd2O54851 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjd2O54851 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjd2O54851 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjd2O54851 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjd2O54851 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjd2O54851 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjd2O54851 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjd2O54851 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjd2O54851 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjd2O54851 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjd2O54851 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjd2O54851 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjd2O54851 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjd2O54851 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjd2O54851 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjd2O54851 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjd2O54851 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjd2O54851 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjd2O54851 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjd2O54851 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjd2O54851 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjd2O54851 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjd2O54851 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjd2O54851 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjd2O54851 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjd2O54851 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjd2O54851 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjd2O54851 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjd2O54851 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjd2O54851 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjd2O54851 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjd2O54851 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjd2O54851 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjd2O54851 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjd2O54851 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjd2O54851 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjd2O54851 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjd2O54851 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjd2O54851 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjd2O54851 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjd2O54851 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjd2O54851 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjd2O54851 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjd2O54851 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjd2O54851 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjd2O54851 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjd2O54851 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjd2O54851 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjd2O54851 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjd2O54851 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjd2O54851 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjd2O54851 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjd2O54851 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjd2O54851 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjd2O54851 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjd2O54851 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjd2O54851 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjd2O54851 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjd2O54851 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjd2O54851 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjd2O54851 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjd2O54851 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjd2O54851 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjd2O54851 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjd2O54851 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjd2O54851 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjd2O54851 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjd2O54851 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjd2O54851 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjd2O54851 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjd2O54851 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjd2O54851 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjd2O54851 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjd2O54851 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjd2O54851 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjd2O54851 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjd2O54851 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjd2O54851 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjd2O54851 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjd2O54851 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjd2O54851 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjd2O54851 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms