Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DffaO54786 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DffaO54786 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DffaO54786 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DffaO54786 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DffaO54786 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DffaO54786 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DffaO54786 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DffaO54786 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DffaO54786 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DffaO54786 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DffaO54786 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DffaO54786 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DffaO54786 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DffaO54786 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DffaO54786 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DffaO54786 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DffaO54786 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DffaO54786 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DffaO54786 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DffaO54786 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DffaO54786 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DffaO54786 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DffaO54786 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DffaO54786 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DffaO54786 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DffaO54786 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DffaO54786 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DffaO54786 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DffaO54786 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DffaO54786 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DffaO54786 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DffaO54786 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DffaO54786 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DffaO54786 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DffaO54786 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DffaO54786 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DffaO54786 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DffaO54786 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DffaO54786 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DffaO54786 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DffaO54786 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DffaO54786 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DffaO54786 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DffaO54786 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DffaO54786 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DffaO54786 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DffaO54786 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DffaO54786 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DffaO54786 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DffaO54786 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DffaO54786 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DffaO54786 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DffaO54786 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DffaO54786 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DffaO54786 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DffaO54786 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DffaO54786 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DffaO54786 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DffaO54786 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DffaO54786 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DffaO54786 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DffaO54786 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DffaO54786 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DffaO54786 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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DffaO54786 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DffaO54786 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DffaO54786 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DffaO54786 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DffaO54786 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DffaO54786 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DffaO54786 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DffaO54786 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DffaO54786 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DffaO54786 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DffaO54786 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DffaO54786 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DffaO54786 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DffaO54786 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DffaO54786 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DffaO54786 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DffaO54786 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DffaO54786 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DffaO54786 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DffaO54786 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DffaO54786 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DffaO54786 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DffaO54786 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DffaO54786 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DffaO54786 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DffaO54786 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DffaO54786 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DffaO54786 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DffaO54786 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DffaO54786 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DffaO54786 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DffaO54786 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DffaO54786 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DffaO54786 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms