Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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