Protein–RNA interactions for Protein: O35942

Nek2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek2O35942 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek2O35942 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nek2O35942 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nek2O35942 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek2O35942 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms