Protein–RNA interactions for Protein: O35903

Ccl25, C-C motif chemokine 25, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl25O35903 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Ccl25O35903 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Ccl25O35903 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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