Protein–RNA interactions for Protein: O35739

Klf9, Krueppel-like factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf9O35739 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Klf9O35739 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klf9O35739 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klf9O35739 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klf9O35739 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klf9O35739 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klf9O35739 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klf9O35739 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klf9O35739 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Klf9O35739 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klf9O35739 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klf9O35739 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klf9O35739 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Klf9O35739 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klf9O35739 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klf9O35739 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Klf9O35739 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klf9O35739 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klf9O35739 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klf9O35739 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klf9O35739 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klf9O35739 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klf9O35739 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klf9O35739 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klf9O35739 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klf9O35739 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klf9O35739 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klf9O35739 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klf9O35739 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klf9O35739 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Klf9O35739 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Klf9O35739 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Klf9O35739 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Klf9O35739 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Klf9O35739 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Klf9O35739 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Klf9O35739 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Klf9O35739 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Klf9O35739 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Klf9O35739 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Klf9O35739 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Klf9O35739 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Klf9O35739 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Klf9O35739 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Klf9O35739 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Klf9O35739 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Klf9O35739 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Klf9O35739 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Klf9O35739 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Klf9O35739 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Klf9O35739 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Klf9O35739 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Klf9O35739 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Klf9O35739 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Klf9O35739 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Klf9O35739 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Klf9O35739 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Klf9O35739 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Klf9O35739 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Klf9O35739 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Klf9O35739 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Klf9O35739 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Klf9O35739 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Klf9O35739 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Klf9O35739 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Klf9O35739 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Klf9O35739 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Klf9O35739 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Klf9O35739 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Klf9O35739 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Klf9O35739 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Klf9O35739 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Klf9O35739 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Klf9O35739 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Klf9O35739 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Klf9O35739 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Klf9O35739 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Klf9O35739 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Klf9O35739 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Klf9O35739 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Klf9O35739 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Klf9O35739 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Klf9O35739 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Klf9O35739 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Klf9O35739 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Klf9O35739 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Klf9O35739 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Klf9O35739 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Klf9O35739 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Klf9O35739 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Klf9O35739 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Klf9O35739 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Klf9O35739 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Klf9O35739 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Klf9O35739 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Klf9O35739 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Klf9O35739 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Klf9O35739 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Klf9O35739 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Klf9O35739 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms