Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Stag2O35638 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Stag2O35638 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Stag2O35638 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Stag2O35638 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Stag2O35638 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Stag2O35638 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Stag2O35638 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Stag2O35638 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Stag2O35638 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Stag2O35638 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Stag2O35638 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Stag2O35638 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stag2O35638 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stag2O35638 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stag2O35638 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stag2O35638 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stag2O35638 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stag2O35638 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stag2O35638 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stag2O35638 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stag2O35638 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stag2O35638 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stag2O35638 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stag2O35638 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stag2O35638 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Stag2O35638 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stag2O35638 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stag2O35638 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stag2O35638 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stag2O35638 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stag2O35638 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stag2O35638 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stag2O35638 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stag2O35638 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stag2O35638 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stag2O35638 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stag2O35638 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stag2O35638 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stag2O35638 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stag2O35638 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stag2O35638 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stag2O35638 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stag2O35638 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stag2O35638 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stag2O35638 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stag2O35638 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stag2O35638 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stag2O35638 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Stag2O35638 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stag2O35638 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stag2O35638 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stag2O35638 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stag2O35638 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stag2O35638 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stag2O35638 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stag2O35638 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stag2O35638 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stag2O35638 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stag2O35638 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stag2O35638 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Stag2O35638 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Stag2O35638 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Stag2O35638 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Stag2O35638 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Stag2O35638 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Stag2O35638 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Stag2O35638 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Stag2O35638 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Stag2O35638 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Stag2O35638 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Stag2O35638 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Stag2O35638 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Stag2O35638 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Stag2O35638 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Stag2O35638 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Stag2O35638 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Stag2O35638 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Stag2O35638 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Stag2O35638 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Stag2O35638 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Stag2O35638 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Stag2O35638 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Stag2O35638 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Stag2O35638 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Stag2O35638 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Stag2O35638 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Stag2O35638 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Stag2O35638 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Stag2O35638 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Stag2O35638 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Stag2O35638 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Stag2O35638 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Stag2O35638 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Stag2O35638 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Stag2O35638 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Stag2O35638 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Stag2O35638 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Stag2O35638 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Stag2O35638 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms