Protein–RNA interactions for Protein: O35602

Rax, Retinal homeobox protein Rx, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaxO35602 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RaxO35602 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RaxO35602 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RaxO35602 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RaxO35602 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RaxO35602 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RaxO35602 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RaxO35602 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RaxO35602 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RaxO35602 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RaxO35602 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RaxO35602 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RaxO35602 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RaxO35602 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RaxO35602 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RaxO35602 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RaxO35602 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RaxO35602 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RaxO35602 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RaxO35602 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RaxO35602 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RaxO35602 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RaxO35602 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RaxO35602 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RaxO35602 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RaxO35602 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RaxO35602 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RaxO35602 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RaxO35602 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RaxO35602 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RaxO35602 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RaxO35602 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RaxO35602 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RaxO35602 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RaxO35602 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RaxO35602 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RaxO35602 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RaxO35602 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RaxO35602 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RaxO35602 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RaxO35602 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RaxO35602 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RaxO35602 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RaxO35602 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RaxO35602 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RaxO35602 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RaxO35602 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RaxO35602 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RaxO35602 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RaxO35602 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RaxO35602 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RaxO35602 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RaxO35602 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RaxO35602 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RaxO35602 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RaxO35602 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RaxO35602 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RaxO35602 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RaxO35602 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RaxO35602 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RaxO35602 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RaxO35602 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RaxO35602 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RaxO35602 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RaxO35602 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RaxO35602 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RaxO35602 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RaxO35602 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RaxO35602 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RaxO35602 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RaxO35602 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RaxO35602 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RaxO35602 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RaxO35602 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RaxO35602 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RaxO35602 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RaxO35602 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RaxO35602 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RaxO35602 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RaxO35602 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RaxO35602 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RaxO35602 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RaxO35602 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RaxO35602 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RaxO35602 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RaxO35602 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RaxO35602 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RaxO35602 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RaxO35602 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RaxO35602 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RaxO35602 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RaxO35602 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RaxO35602 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RaxO35602 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RaxO35602 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RaxO35602 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RaxO35602 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RaxO35602 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RaxO35602 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RaxO35602 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms