Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clk2O35491 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clk2O35491 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clk2O35491 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clk2O35491 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clk2O35491 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Clk2O35491 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clk2O35491 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clk2O35491 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clk2O35491 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clk2O35491 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clk2O35491 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clk2O35491 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clk2O35491 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clk2O35491 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clk2O35491 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clk2O35491 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clk2O35491 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clk2O35491 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clk2O35491 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clk2O35491 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clk2O35491 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clk2O35491 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Clk2O35491 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clk2O35491 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clk2O35491 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clk2O35491 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clk2O35491 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clk2O35491 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clk2O35491 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clk2O35491 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clk2O35491 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clk2O35491 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clk2O35491 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clk2O35491 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clk2O35491 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clk2O35491 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clk2O35491 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clk2O35491 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clk2O35491 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clk2O35491 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clk2O35491 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clk2O35491 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clk2O35491 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clk2O35491 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clk2O35491 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clk2O35491 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clk2O35491 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clk2O35491 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clk2O35491 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clk2O35491 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clk2O35491 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clk2O35491 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clk2O35491 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clk2O35491 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clk2O35491 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clk2O35491 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clk2O35491 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clk2O35491 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clk2O35491 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clk2O35491 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clk2O35491 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clk2O35491 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clk2O35491 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clk2O35491 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clk2O35491 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clk2O35491 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Clk2O35491 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clk2O35491 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clk2O35491 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clk2O35491 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clk2O35491 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clk2O35491 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clk2O35491 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clk2O35491 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Clk2O35491 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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