Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abcc1O35379 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abcc1O35379 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abcc1O35379 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abcc1O35379 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abcc1O35379 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abcc1O35379 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Abcc1O35379 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Abcc1O35379 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abcc1O35379 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Abcc1O35379 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abcc1O35379 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abcc1O35379 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abcc1O35379 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abcc1O35379 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Abcc1O35379 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Abcc1O35379 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Abcc1O35379 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Abcc1O35379 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Abcc1O35379 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Abcc1O35379 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Abcc1O35379 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Abcc1O35379 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Abcc1O35379 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Abcc1O35379 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Abcc1O35379 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abcc1O35379 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Abcc1O35379 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abcc1O35379 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Abcc1O35379 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abcc1O35379 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abcc1O35379 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abcc1O35379 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abcc1O35379 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcc1O35379 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcc1O35379 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcc1O35379 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcc1O35379 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcc1O35379 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcc1O35379 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcc1O35379 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcc1O35379 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcc1O35379 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcc1O35379 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcc1O35379 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcc1O35379 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcc1O35379 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcc1O35379 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcc1O35379 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcc1O35379 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abcc1O35379 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abcc1O35379 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abcc1O35379 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abcc1O35379 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abcc1O35379 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abcc1O35379 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abcc1O35379 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abcc1O35379 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abcc1O35379 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abcc1O35379 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abcc1O35379 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abcc1O35379 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abcc1O35379 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Abcc1O35379 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abcc1O35379 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abcc1O35379 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abcc1O35379 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abcc1O35379 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abcc1O35379 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Abcc1O35379 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Abcc1O35379 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Abcc1O35379 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Abcc1O35379 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Abcc1O35379 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Abcc1O35379 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Abcc1O35379 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Abcc1O35379 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Abcc1O35379 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Abcc1O35379 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Abcc1O35379 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Abcc1O35379 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Abcc1O35379 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Abcc1O35379 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Abcc1O35379 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Abcc1O35379 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Abcc1O35379 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Abcc1O35379 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Abcc1O35379 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Abcc1O35379 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Abcc1O35379 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Abcc1O35379 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Abcc1O35379 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Abcc1O35379 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Abcc1O35379 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Abcc1O35379 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Abcc1O35379 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Abcc1O35379 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Abcc1O35379 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Abcc1O35379 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Abcc1O35379 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms