Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms