Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms