Protein–RNA interactions for Protein: O35074

Ptgis, Prostacyclin synthase, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgisO35074 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtgisO35074 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtgisO35074 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtgisO35074 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtgisO35074 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtgisO35074 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtgisO35074 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PtgisO35074 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PtgisO35074 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtgisO35074 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtgisO35074 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtgisO35074 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtgisO35074 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtgisO35074 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtgisO35074 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtgisO35074 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtgisO35074 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtgisO35074 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtgisO35074 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtgisO35074 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtgisO35074 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtgisO35074 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtgisO35074 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtgisO35074 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtgisO35074 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtgisO35074 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtgisO35074 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtgisO35074 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtgisO35074 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtgisO35074 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtgisO35074 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtgisO35074 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtgisO35074 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PtgisO35074 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtgisO35074 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtgisO35074 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtgisO35074 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtgisO35074 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PtgisO35074 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtgisO35074 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtgisO35074 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtgisO35074 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtgisO35074 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtgisO35074 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtgisO35074 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtgisO35074 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtgisO35074 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtgisO35074 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtgisO35074 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtgisO35074 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtgisO35074 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtgisO35074 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtgisO35074 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtgisO35074 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtgisO35074 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtgisO35074 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtgisO35074 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtgisO35074 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtgisO35074 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtgisO35074 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtgisO35074 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtgisO35074 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtgisO35074 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtgisO35074 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtgisO35074 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtgisO35074 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtgisO35074 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtgisO35074 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtgisO35074 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtgisO35074 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtgisO35074 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtgisO35074 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtgisO35074 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtgisO35074 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtgisO35074 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtgisO35074 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtgisO35074 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtgisO35074 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtgisO35074 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtgisO35074 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtgisO35074 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtgisO35074 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtgisO35074 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtgisO35074 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtgisO35074 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtgisO35074 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtgisO35074 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtgisO35074 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtgisO35074 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtgisO35074 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtgisO35074 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtgisO35074 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtgisO35074 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtgisO35074 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtgisO35074 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PtgisO35074 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtgisO35074 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PtgisO35074 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtgisO35074 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtgisO35074 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms