Protein–RNA interactions for Protein: O09102

Gcm2, Chorion-specific transcription factor GCMb, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcm2O09102 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.6 ms