Protein–RNA interactions for Protein: O08976

Pbsn, Probasin, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PbsnO08976 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
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PbsnO08976 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PbsnO08976 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PbsnO08976 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PbsnO08976 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PbsnO08976 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PbsnO08976 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PbsnO08976 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PbsnO08976 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PbsnO08976 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
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PbsnO08976 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PbsnO08976 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PbsnO08976 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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PbsnO08976 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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PbsnO08976 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PbsnO08976 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PbsnO08976 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PbsnO08976 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PbsnO08976 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PbsnO08976 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PbsnO08976 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
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PbsnO08976 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PbsnO08976 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PbsnO08976 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PbsnO08976 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PbsnO08976 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PbsnO08976 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PbsnO08976 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PbsnO08976 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PbsnO08976 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PbsnO08976 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PbsnO08976 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PbsnO08976 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PbsnO08976 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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PbsnO08976 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PbsnO08976 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PbsnO08976 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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PbsnO08976 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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PbsnO08976 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PbsnO08976 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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PbsnO08976 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PbsnO08976 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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PbsnO08976 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PbsnO08976 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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PbsnO08976 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PbsnO08976 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PbsnO08976 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PbsnO08976 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PbsnO08976 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PbsnO08976 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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PbsnO08976 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PbsnO08976 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PbsnO08976 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PbsnO08976 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PbsnO08976 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PbsnO08976 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PbsnO08976 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PbsnO08976 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PbsnO08976 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PbsnO08976 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PbsnO08976 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PbsnO08976 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PbsnO08976 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PbsnO08976 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PbsnO08976 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PbsnO08976 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PbsnO08976 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PbsnO08976 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PbsnO08976 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PbsnO08976 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms