Protein–RNA interactions for Protein: O08919

Numbl, Numb-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NumblO08919 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NumblO08919 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NumblO08919 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NumblO08919 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NumblO08919 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NumblO08919 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NumblO08919 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NumblO08919 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NumblO08919 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NumblO08919 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NumblO08919 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NumblO08919 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NumblO08919 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NumblO08919 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NumblO08919 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NumblO08919 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NumblO08919 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NumblO08919 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NumblO08919 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NumblO08919 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NumblO08919 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NumblO08919 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NumblO08919 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NumblO08919 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NumblO08919 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NumblO08919 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NumblO08919 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NumblO08919 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NumblO08919 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NumblO08919 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NumblO08919 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NumblO08919 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NumblO08919 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NumblO08919 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NumblO08919 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NumblO08919 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NumblO08919 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NumblO08919 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NumblO08919 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NumblO08919 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NumblO08919 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NumblO08919 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NumblO08919 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NumblO08919 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NumblO08919 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NumblO08919 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NumblO08919 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NumblO08919 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NumblO08919 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NumblO08919 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NumblO08919 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NumblO08919 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NumblO08919 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NumblO08919 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NumblO08919 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NumblO08919 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NumblO08919 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NumblO08919 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NumblO08919 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NumblO08919 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NumblO08919 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NumblO08919 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NumblO08919 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NumblO08919 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NumblO08919 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NumblO08919 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NumblO08919 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NumblO08919 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NumblO08919 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NumblO08919 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NumblO08919 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NumblO08919 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NumblO08919 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NumblO08919 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NumblO08919 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NumblO08919 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NumblO08919 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NumblO08919 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NumblO08919 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NumblO08919 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NumblO08919 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NumblO08919 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NumblO08919 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NumblO08919 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NumblO08919 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NumblO08919 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NumblO08919 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NumblO08919 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NumblO08919 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NumblO08919 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NumblO08919 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NumblO08919 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NumblO08919 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NumblO08919 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NumblO08919 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NumblO08919 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NumblO08919 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NumblO08919 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NumblO08919 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NumblO08919 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms