Protein–RNA interactions for Protein: O08856

Ell, RNA polymerase II elongation factor ELL, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EllO08856 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EllO08856 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
EllO08856 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
EllO08856 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
EllO08856 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
EllO08856 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
EllO08856 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
EllO08856 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
EllO08856 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
EllO08856 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
EllO08856 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
EllO08856 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
EllO08856 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
EllO08856 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
EllO08856 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
EllO08856 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
EllO08856 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
EllO08856 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
EllO08856 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
EllO08856 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
EllO08856 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
EllO08856 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
EllO08856 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
EllO08856 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
EllO08856 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
EllO08856 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
EllO08856 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
EllO08856 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
EllO08856 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
EllO08856 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
EllO08856 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
EllO08856 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
EllO08856 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EllO08856 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EllO08856 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EllO08856 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EllO08856 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EllO08856 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EllO08856 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EllO08856 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EllO08856 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
EllO08856 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
EllO08856 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
EllO08856 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EllO08856 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EllO08856 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EllO08856 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EllO08856 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EllO08856 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
EllO08856 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EllO08856 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EllO08856 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EllO08856 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EllO08856 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EllO08856 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EllO08856 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EllO08856 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EllO08856 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
EllO08856 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EllO08856 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EllO08856 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
EllO08856 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EllO08856 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EllO08856 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EllO08856 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EllO08856 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EllO08856 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EllO08856 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EllO08856 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EllO08856 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
EllO08856 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EllO08856 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EllO08856 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EllO08856 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EllO08856 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EllO08856 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EllO08856 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
EllO08856 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EllO08856 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EllO08856 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EllO08856 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EllO08856 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EllO08856 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EllO08856 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EllO08856 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
EllO08856 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EllO08856 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EllO08856 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EllO08856 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EllO08856 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EllO08856 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EllO08856 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
EllO08856 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EllO08856 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EllO08856 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EllO08856 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
EllO08856 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EllO08856 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EllO08856 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EllO08856 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms