Protein–RNA interactions for Protein: O08842

Gfra2, GDNF family receptor alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra2O08842 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms