Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms