Protein–RNA interactions for Protein: O08686

Barx2, Homeobox protein BarH-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx2O08686 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Barx2O08686 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Barx2O08686 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Barx2O08686 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Barx2O08686 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Barx2O08686 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Barx2O08686 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Barx2O08686 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Barx2O08686 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Barx2O08686 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Barx2O08686 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Barx2O08686 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Barx2O08686 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Barx2O08686 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Barx2O08686 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Barx2O08686 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Barx2O08686 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Barx2O08686 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Barx2O08686 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Barx2O08686 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Barx2O08686 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Barx2O08686 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Barx2O08686 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Barx2O08686 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Barx2O08686 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Barx2O08686 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Barx2O08686 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Barx2O08686 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Barx2O08686 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Barx2O08686 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Barx2O08686 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Barx2O08686 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Barx2O08686 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Barx2O08686 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Barx2O08686 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Barx2O08686 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Barx2O08686 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Barx2O08686 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Barx2O08686 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Barx2O08686 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Barx2O08686 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Barx2O08686 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Barx2O08686 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Barx2O08686 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Barx2O08686 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Barx2O08686 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Barx2O08686 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Barx2O08686 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Barx2O08686 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Barx2O08686 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Barx2O08686 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Barx2O08686 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Barx2O08686 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Barx2O08686 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Barx2O08686 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Barx2O08686 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Barx2O08686 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Barx2O08686 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Barx2O08686 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Barx2O08686 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Barx2O08686 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Barx2O08686 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Barx2O08686 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Barx2O08686 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Barx2O08686 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Barx2O08686 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Barx2O08686 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Barx2O08686 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Barx2O08686 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Barx2O08686 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Barx2O08686 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Barx2O08686 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Barx2O08686 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Barx2O08686 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Barx2O08686 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Barx2O08686 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Barx2O08686 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Barx2O08686 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Barx2O08686 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Barx2O08686 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Barx2O08686 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Barx2O08686 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Barx2O08686 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Barx2O08686 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Barx2O08686 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Barx2O08686 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Barx2O08686 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Barx2O08686 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Barx2O08686 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Barx2O08686 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Barx2O08686 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Barx2O08686 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Barx2O08686 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Barx2O08686 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Barx2O08686 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Barx2O08686 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Barx2O08686 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Barx2O08686 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Barx2O08686 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Barx2O08686 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms