Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MttpO08601 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MttpO08601 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MttpO08601 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MttpO08601 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MttpO08601 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MttpO08601 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MttpO08601 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MttpO08601 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MttpO08601 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MttpO08601 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MttpO08601 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MttpO08601 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MttpO08601 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MttpO08601 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MttpO08601 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MttpO08601 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MttpO08601 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MttpO08601 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MttpO08601 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MttpO08601 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MttpO08601 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MttpO08601 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MttpO08601 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MttpO08601 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MttpO08601 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MttpO08601 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MttpO08601 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MttpO08601 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MttpO08601 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MttpO08601 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MttpO08601 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MttpO08601 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MttpO08601 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MttpO08601 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MttpO08601 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MttpO08601 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MttpO08601 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MttpO08601 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MttpO08601 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MttpO08601 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MttpO08601 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MttpO08601 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MttpO08601 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MttpO08601 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MttpO08601 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MttpO08601 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MttpO08601 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MttpO08601 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MttpO08601 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MttpO08601 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MttpO08601 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MttpO08601 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MttpO08601 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MttpO08601 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MttpO08601 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MttpO08601 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MttpO08601 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MttpO08601 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MttpO08601 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MttpO08601 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MttpO08601 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MttpO08601 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MttpO08601 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MttpO08601 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MttpO08601 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MttpO08601 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MttpO08601 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MttpO08601 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MttpO08601 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MttpO08601 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MttpO08601 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MttpO08601 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MttpO08601 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MttpO08601 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MttpO08601 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MttpO08601 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MttpO08601 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MttpO08601 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MttpO08601 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MttpO08601 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MttpO08601 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MttpO08601 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MttpO08601 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MttpO08601 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MttpO08601 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MttpO08601 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MttpO08601 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MttpO08601 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MttpO08601 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MttpO08601 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MttpO08601 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MttpO08601 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MttpO08601 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MttpO08601 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MttpO08601 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MttpO08601 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MttpO08601 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MttpO08601 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MttpO08601 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms