Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sec22bO08547 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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