Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
MsmbO08540 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MsmbO08540 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MsmbO08540 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
MsmbO08540 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MsmbO08540 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
MsmbO08540 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MsmbO08540 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
MsmbO08540 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
MsmbO08540 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
MsmbO08540 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MsmbO08540 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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