Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D9

Gm3239, Predicted gene 3239, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3239L7N2D9 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Gm3239L7N2D9 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Gm3239L7N2D9 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Gm3239L7N2D9 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Gm3239L7N2D9 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Gm3239L7N2D9 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Gm3239L7N2D9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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