Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20939L7N243 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20939L7N243 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20939L7N243 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20939L7N243 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20939L7N243 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20939L7N243 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20939L7N243 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20939L7N243 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20939L7N243 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20939L7N243 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20939L7N243 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20939L7N243 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20939L7N243 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20939L7N243 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20939L7N243 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20939L7N243 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20939L7N243 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20939L7N243 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20939L7N243 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20939L7N243 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20939L7N243 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20939L7N243 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20939L7N243 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20939L7N243 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20939L7N243 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20939L7N243 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20939L7N243 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20939L7N243 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20939L7N243 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20939L7N243 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20939L7N243 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20939L7N243 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20939L7N243 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20939L7N243 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20939L7N243 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20939L7N243 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20939L7N243 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20939L7N243 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20939L7N243 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20939L7N243 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20939L7N243 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20939L7N243 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20939L7N243 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm20939L7N243 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm20939L7N243 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm20939L7N243 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm20939L7N243 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm20939L7N243 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20939L7N243 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20939L7N243 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20939L7N243 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20939L7N243 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20939L7N243 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20939L7N243 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20939L7N243 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20939L7N243 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20939L7N243 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20939L7N243 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20939L7N243 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20939L7N243 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20939L7N243 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20939L7N243 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20939L7N243 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20939L7N243 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20939L7N243 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20939L7N243 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20939L7N243 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20939L7N243 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20939L7N243 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20939L7N243 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20939L7N243 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20939L7N243 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20939L7N243 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20939L7N243 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20939L7N243 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20939L7N243 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20939L7N243 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20939L7N243 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20939L7N243 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20939L7N243 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20939L7N243 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20939L7N243 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20939L7N243 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20939L7N243 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20939L7N243 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20939L7N243 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20939L7N243 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20939L7N243 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20939L7N243 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20939L7N243 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20939L7N243 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20939L7N243 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20939L7N243 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20939L7N243 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20939L7N243 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20939L7N243 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20939L7N243 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20939L7N243 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20939L7N243 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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