Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms