Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms