Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim18J3QNP2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms