Protein–RNA interactions for Protein: J3QNG1

Gm6408, Predicted gene 6408, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6408J3QNG1 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6408J3QNG1 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6408J3QNG1 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6408J3QNG1 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6408J3QNG1 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6408J3QNG1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6408J3QNG1 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6408J3QNG1 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6408J3QNG1 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6408J3QNG1 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6408J3QNG1 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6408J3QNG1 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6408J3QNG1 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6408J3QNG1 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6408J3QNG1 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6408J3QNG1 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6408J3QNG1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6408J3QNG1 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6408J3QNG1 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6408J3QNG1 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6408J3QNG1 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6408J3QNG1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6408J3QNG1 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6408J3QNG1 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6408J3QNG1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6408J3QNG1 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6408J3QNG1 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6408J3QNG1 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6408J3QNG1 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6408J3QNG1 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6408J3QNG1 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6408J3QNG1 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6408J3QNG1 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6408J3QNG1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6408J3QNG1 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6408J3QNG1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6408J3QNG1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6408J3QNG1 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6408J3QNG1 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6408J3QNG1 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6408J3QNG1 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6408J3QNG1 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6408J3QNG1 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6408J3QNG1 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6408J3QNG1 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6408J3QNG1 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6408J3QNG1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6408J3QNG1 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6408J3QNG1 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6408J3QNG1 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6408J3QNG1 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6408J3QNG1 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6408J3QNG1 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6408J3QNG1 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6408J3QNG1 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6408J3QNG1 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6408J3QNG1 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6408J3QNG1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6408J3QNG1 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6408J3QNG1 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6408J3QNG1 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6408J3QNG1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6408J3QNG1 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6408J3QNG1 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6408J3QNG1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6408J3QNG1 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6408J3QNG1 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6408J3QNG1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6408J3QNG1 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6408J3QNG1 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6408J3QNG1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6408J3QNG1 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6408J3QNG1 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6408J3QNG1 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6408J3QNG1 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6408J3QNG1 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6408J3QNG1 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6408J3QNG1 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6408J3QNG1 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6408J3QNG1 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6408J3QNG1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6408J3QNG1 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6408J3QNG1 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6408J3QNG1 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6408J3QNG1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6408J3QNG1 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6408J3QNG1 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6408J3QNG1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6408J3QNG1 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6408J3QNG1 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6408J3QNG1 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6408J3QNG1 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6408J3QNG1 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6408J3QNG1 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6408J3QNG1 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6408J3QNG1 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6408J3QNG1 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6408J3QNG1 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6408J3QNG1 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6408J3QNG1 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms