Protein–RNA interactions for Protein: J3QMY9

Top6bl, Type 2 DNA topoisomerase 6 subunit B-like, mousemouse

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top6blJ3QMY9 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
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Top6blJ3QMY9 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Top6blJ3QMY9 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Top6blJ3QMY9 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Top6blJ3QMY9 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Top6blJ3QMY9 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Top6blJ3QMY9 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Top6blJ3QMY9 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Top6blJ3QMY9 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Top6blJ3QMY9 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Top6blJ3QMY9 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Top6blJ3QMY9 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Top6blJ3QMY9 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Top6blJ3QMY9 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Top6blJ3QMY9 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Top6blJ3QMY9 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Top6blJ3QMY9 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Top6blJ3QMY9 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Top6blJ3QMY9 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Top6blJ3QMY9 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Top6blJ3QMY9 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Top6blJ3QMY9 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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