Protein–RNA interactions for Protein: J3QME6

Lipo1, Lipase, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lipo1J3QME6 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lipo1J3QME6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms