Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms