Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Gm21818J3KMS6 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Gm21818J3KMS6 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
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Gm21818J3KMS6 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Gm21818J3KMS6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Gm21818J3KMS6 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Gm21818J3KMS6 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
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Gm21818J3KMS6 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Gm21818J3KMS6 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Gm21818J3KMS6 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Gm21818J3KMS6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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